时空转录组FF

解锁组织样本中的隐藏基因密码


时空转录组FF(Spatiotemporal Transcriptomics FF)是一种结合空间信息和时间信息的高分辨率转录组学技术,主要用于分析组织样本中基因表达的空间和时间特征,尤其是针对新鲜冷冻(Fresh Frozen, FF)样本。

FF样本指的是未经固定的组织样本,通常保持了较为完整的生物学信息,因此在时空转录组学研究中,FF样本广泛应用于基因表达的空间定位分析。时空转录组FF产品方案结合了“纳米级分辨率”和“厘米级全景视野”,为“组织到数据”的整体解决方案提供了全方位支持。该方案通过使用带有空间坐标信息的Poly T捕获探针,实现对新鲜冷冻样本中细胞内mRNA分子的原位捕获,并通过空间条形码(Coordinate ID,CID)精确还原其空间位置,从而实现组织的空间信息检测。

科学可视化图像
产品目标手风琴
  • 精准的时空表达图谱:通过对FFPE组织样本的时空转录组分析,构建详细的基因表达图谱,揭示不同组织区域、不同发育阶段或不同病理状态下的转录组差异。
  • 疾病研究与临床应用:帮助研究人员在肿瘤、免疫疾病等领域了解病变组织的空间异质性,为靶向治疗、个性化诊疗提供重要数据支持。
  • 药物研发:该产品方案利用具有空间坐标信息的Poly T捕获探针,在新鲜冷冻(FF)样本中对mRNA分子进行原位捕获。Poly T探针能够有效地捕捉mRNA中的Poly A尾部分子,而空间坐标则能够将捕获的mRNA与其在组织中的具体位置进行关联。
  • 空间条形码(Coordinate ID,CID):时空转录组FF方案采用空间条形码技术,即为每一个捕获点赋予独特的空间坐标ID(CID)。这一标识符可以在数据分析过程中,帮助将每个mRNA分子与其空间位置一一对应,实现精确的空间信息还原。
  • 组织到数据的整体解决方案:该产品方案不仅仅局限于捕获和分析mRNA表达,还包含从样本准备、数据采集到数据分析的全流程解决方案。研究者可以通过该方案轻松实现从组织样本到高精度基因表达数据的无缝转换。
  • 疾病研究与诊断:时空转录组FF产品方案能够帮助研究者分析肿瘤等复杂疾病中组织微环境的基因表达异质性,探索疾病发生发展过程中的关键基因与分子机制。
  • 发育生物学:器官发育、细胞分化等研究中,时空转录组FF能够揭示在不同发育阶段或不同组织位置上基因的动态变化,帮助理解复杂生物过程。
  • 个性化医疗:基于该技术的精准空间基因组分析,能够为个性化治疗提供分子水平的依据,尤其在癌症免疫治疗等领域具有重要意义。